人工耳蜗的“植入部份”需经手术内植病人的耳蜗内，此手术约只需两至三小时。根据已发表的手术后报告显示，人工耳蜗内植手术一般是安全的。

人工耳蜗植入手术可能引起的并发症与其他的手术无异，当中包括：痳醉的危险、发炎、感染和流血等。另外，还有一些属于耳朵手术的并发症可能会出现，例如耳朵痳痹或僵硬、面神经痳痹、味觉障碍、头痛、晕眩及耳鸣等。

虽然人工耳蜗内植手术潜在这些风险，但有意参与计划的人士亦不用过份忧虑，因在大多数的情况下，以上提及的症状会随着伤口愈合而消失。

在威尔斯亲王医院，大部份的人工耳蜗植入者均能在手术后廿四小时出院。手术后伤口的愈合通常要一至三周，植入者在这段时间后便可恢复正常活动，而儿童一般在手术后一天便可活动自如。

手术后的康复训练与内植手术在整个计划中是同样重要的；因为人工耳蜗的内植手术并不是治愈已损坏的听力，所以病人需要重新适应及学习运用新仪器所提供的声音刺激，以发展其听力及语言能力。

人工耳蜗内植小组的专业人士，会根据个别病人的需要，制定合适的康复计划。病人必需积极和持续参与训练，这样才可达致人工耳蜗最佳的效果。

成年人
人工耳蜗内植的成效，在许多研究报告中已得到确定。临床试验显示，大部分完成人工耳蜗内植计划的成年人，都可依靠聆听和唇读来增强沟通能力。研究报告亦指出，人工耳蜗内植令许多成年植入者增强自信心，使他们在社交场合更活跃、更投入。另外一部分成年植入者亦因此获得更多工作机会，及改善与家庭和朋友的关系。

有学者指出，一个成功接受人工耳蜗的成年人不但在工作上会更有效率，又因为他们对外沟通及吸收资讯的能力改善了，结果更能融入社会，减低社会在特殊器材和特殊设施方面的开支。另外在教育方面，如果参与人工耳蜗内植计划的儿童，能够融入正常学校接受教育，会为社会减省特殊教育的开支。

人工耳蜗内植计划的每人成本(包括手术、仪器、检查及跟进计划)约为三万美元。